未查明原因的不合理损耗先转入“待处理财产损溢”，同步将对应部分的进项税额做转出处理；待明确损耗责任后，分别结转至“管理费用”“其他应收款”等对应科目。
一、未查明原因阶段核算
采购材料发生不合理损耗时，先将损耗部分的成本和对应进项税额，一并转入待处理财产损溢科目，同时做进项税额转出，不能将不合理损耗计入存货采购成本，分录为：
借：待处理财产损溢
贷：原材料/材料采购
贷：应交税费——应交增值税（进项税额转出）
二、查明原因后分情形结转
由责任人/第三方赔偿：属于供应方、运输方、保险公司或内部过失人责任的，将损耗金额转入“其他应收款”，收到赔偿款后冲销该科目。
管理不善导致损耗：属于内部管理疏漏造成的，报经审批后转入“管理费用”，作为当期经营管理损失列支。
自然灾害等非正常损失：台风、意外灾害等不可抗力造成的损耗，转入“营业外支出——非常损失”，不计入日常经营损益。
三、核心核算原则
不合理损耗不得计入存货成本，避免虚增存货价值、扭曲真实经营成果；只有合理损耗可计入采购总成本，仅调高入库材料的单位成本，无需做进项税额转出。
