纳税人申请留抵退税税务机关应当在多长时限内办结？

 　　根据《国家税务总局关于办理增值税期末留抵退税有关征管事项的公告》(国家税务总局公告2025年第20号)规定，五、税务机关应当按照规定程序和时限受理、审核纳税人的留抵退税申请，并将审核结果告知纳税人。
 　　六、纳税人不存在本公告第七条所列情形的，税务机关应当自受理留抵退税申请之日起(含当日，下同)10个工作日内完成审核，并向纳税人出具《税务事项通知书》。经审核，纳税人符合留抵退税条件的，准予留抵退税，并向纳税人出具准予留抵退税的《税务事项通知书》;纳税人不符合留抵退税条件的，不予留抵退税，并向纳税人出具不予留抵退税的《税务事项通知书》。
 　　纳税人既申报免抵退税又申请办理留抵退税的，税务机关应当先办理免抵退税。办理免抵退税后，纳税人仍符合留抵退税条件的，再办理留抵退税。上述10个工作日，自免抵退税应退税额核准之日起计算。
 　　七、税务机关在办理留抵退税期间，发现纳税人存在以下情形的，暂停为其办理留抵退税：
 　　(一)存在增值税涉税风险疑点的;
 　　(二)被税务稽查立案且未结案的;
 　　(三)增值税申报比对异常未处理的;
 　　(四)取得增值税异常扣税凭证未处理的;
 　　(五)国家税务总局规定的其他情形。
 　　八、本公告第七条列举的增值税涉税风险疑点等情形已排除，且相关事项处理完毕后，按照以下规定办理：
 　　(一)纳税人仍符合留抵退税条件的，税务机关继续为其办理留抵退税，并自增值税涉税风险疑点等情形排除且相关事项处理完毕之日起5个工作日内完成审核，向纳税人出具准予留抵退税的《税务事项通知书》;
 　　(二)纳税人不再符合留抵退税条件的，不予留抵退税。税务机关应当自增值税涉税风险疑点等情形排除且相关事项处理完毕之日起5个工作日内完成审核，并向纳税人出具不予留抵退税的《税务事项通知书》。
 　　九、纳税人存在以下情形的，税务机关应当终止为其办理留抵退税，并自作出终止办理留抵退税决定之日起5个工作日内，向纳税人出具终止办理留抵退税的 《税务事项通知书》：
 　　(一)税务机关对增值税涉税风险疑点进行排查时，发现纳税人涉嫌骗取出口退税、虚开增值税专用发票等增值税重大税收违法行为的;
 　　(二)国家税务总局规定的其他情形。
 　　上述情形处理完毕后，纳税人仍符合留抵退税条件的，可以按照规定重新申请办理留抵退税。　
 　　......
 　　十四、本公告自2025年9月1日起施行。